Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GCN1Q92616 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCN1Q92616 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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