Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms