Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYRIPQ8NFW9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms