Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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