Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ZNF550Q7Z398 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ZNF550Q7Z398 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ZNF550Q7Z398 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ZNF550Q7Z398 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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ZNF550Q7Z398 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ZNF550Q7Z398 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ZNF550Q7Z398 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ZNF550Q7Z398 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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ZNF550Q7Z398 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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