Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms