Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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USP34Q70CQ2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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USP34Q70CQ2 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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USP34Q70CQ2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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USP34Q70CQ2 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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USP34Q70CQ2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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USP34Q70CQ2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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USP34Q70CQ2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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USP34Q70CQ2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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USP34Q70CQ2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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USP34Q70CQ2 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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USP34Q70CQ2 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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