Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CCBE1Q6UXH8 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CCBE1Q6UXH8 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CCBE1Q6UXH8 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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