Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AC017083.4-201ENST00000406334 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms