Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRNP1Q6NT89 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms