Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms