Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms