Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms