Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYTL3Q4VX76 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms