Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms