Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms