Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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