Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DDR2Q16832 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DDR2Q16832 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DDR2Q16832 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DDR2Q16832 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDR2Q16832 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDR2Q16832 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDR2Q16832 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDR2Q16832 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDR2Q16832 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDR2Q16832 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDR2Q16832 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDR2Q16832 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDR2Q16832 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDR2Q16832 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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