Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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PTPROQ16827 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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PTPROQ16827 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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