Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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