Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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GABRA6Q16445 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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GABRA6Q16445 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
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GABRA6Q16445 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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GABRA6Q16445 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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GABRA6Q16445 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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