Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms