Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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