Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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