Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
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BRD3Q15059 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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