Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms