Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H2Q13888 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H2Q13888 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H2Q13888 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H2Q13888 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H2Q13888 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H2Q13888 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H2Q13888 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H2Q13888 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H2Q13888 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H2Q13888 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H2Q13888 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H2Q13888 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H2Q13888 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H2Q13888 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H2Q13888 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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