Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms