Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms