Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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NCOA4Q13772 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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NCOA4Q13772 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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