Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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