Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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CUL4AQ13619 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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CUL4AQ13619 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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CUL4AQ13619 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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CUL4AQ13619 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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CUL4AQ13619 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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CUL4AQ13619 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
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CUL4AQ13619 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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