Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP140Q13342 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP140Q13342 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP140Q13342 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP140Q13342 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP140Q13342 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP140Q13342 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP140Q13342 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP140Q13342 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SP140Q13342 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP140Q13342 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SP140Q13342 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP140Q13342 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SP140Q13342 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP140Q13342 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SP140Q13342 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP140Q13342 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP140Q13342 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP140Q13342 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP140Q13342 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP140Q13342 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP140Q13342 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP140Q13342 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP140Q13342 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP140Q13342 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SP140Q13342 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP140Q13342 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SP140Q13342 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP140Q13342 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SP140Q13342 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SP140Q13342 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SP140Q13342 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP140Q13342 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SP140Q13342 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP140Q13342 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SP140Q13342 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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SP140Q13342 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SP140Q13342 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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SP140Q13342 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SP140Q13342 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SP140Q13342 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SP140Q13342 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SP140Q13342 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SP140Q13342 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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