Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 COPZ1-207ENST00000549116 736 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.053e-8■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 COPZ1-206ENST00000549043 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.073e-8■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 COPZ1-202ENST00000455864 880 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.353e-8■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 COPZ1-209ENST00000550171 1026 ntTSL 211.27□□□□□ -0.613e-8■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 RPS2-215ENST00000533872 1114 ntTSL 528.96■■■□□ 2.231e-47■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 NUP107-205ENST00000535718 2655 ntTSL 1 (best)11.9□□□□□ -0.53e-7■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 NUP107-201ENST00000229179 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.913e-7■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.463e-7■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 TXNDC17-207ENST00000574734 616 ntTSL 323.86■■□□□ 1.411e-8■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.451e-8■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 TXNDC17-206ENST00000574429 2100 nt16.97■□□□□ 0.311e-8■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.261e-8■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.011e-8■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 TXNDC17-209ENST00000576020 391 ntTSL 214.02□□□□□ -0.171e-8■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 TXNDC17-205ENST00000573792 505 ntTSL 313.5□□□□□ -0.251e-8■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 TXNDC17-210ENST00000577146 518 ntTSL 24.43□□□□□ -1.71e-8■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 TXNDC17-203ENST00000571029 420 ntTSL 23.94□□□□□ -1.781e-8■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.52e-7■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 MSN-201ENST00000360270 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.944e-15■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 PFKL-203ENST00000460020 890 ntTSL 527.16■■□□□ 1.943e-6■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 QKI-204ENST00000361758 6085 ntTSL 524.76■■□□□ 1.553e-6■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 PIH1D1-213ENST00000597415 874 ntTSL 519.84■□□□□ 0.773e-6■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.773e-6■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 SLC25A37-210ENST00000522164 571 ntTSL 219.72■□□□□ 0.752e-11■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 BAP1-207ENST00000478368 1234 ntTSL 1 (best)17.17■□□□□ 0.343e-6■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 PIH1D1-203ENST00000593900 932 ntTSL 217.01■□□□□ 0.313e-6■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 BAP1-203ENST00000466093 1127 ntTSL 516.05■□□□□ 0.163e-6■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.23e-6■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 UBAP2L-207ENST00000428931 3988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.523e-6■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 ECE1-202ENST00000357071 3763 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.563e-6■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 UBAP2L-201ENST00000271877 3997 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.633e-6■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 UBAP2L-208ENST00000433615 1789 ntTSL 1 (best)10.29□□□□□ -0.763e-6■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 RAD21-201ENST00000297338 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.813e-6■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 DAZAP2-208ENST00000549555 872 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.942e-11■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.023e-6■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.052e-11■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 UBAP2L-218ENST00000493867 677 ntTSL 35.99□□□□□ -1.453e-6■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 EIF3E-214ENST00000522352 611 ntTSL 36.09□□□□□ -1.431e-8■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.892e-6■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 DNM2-213ENST00000589106 565 ntTSL 211.86□□□□□ -0.512e-9■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 PPIL2-207ENST00000462188 1735 ntTSL 218.83■□□□□ 0.62e-14■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 PPIL2-205ENST00000446951 1926 ntTSL 1 (best)17.12■□□□□ 0.332e-14■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.22e-14■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.322e-14■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 PPIL2-204ENST00000417788 4213 ntTSL 211.19□□□□□ -0.622e-14■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 PPIL2-203ENST00000406385 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.722e-14■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.253e-25■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.81e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TADA3-205ENST00000492103 1868 ntTSL 214.53□□□□□ -0.081e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ILK-209ENST00000528784 947 ntTSL 211.05□□□□□ -0.644e-7■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.838e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 NADK-203ENST00000342348 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.53■□□□□ 0.568e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.028e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 NADK-204ENST00000378625 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.358e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RACK1-234ENST00000515417 873 ntTSL 311.53□□□□□ -0.565e-61■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.372e-9■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.122e-9■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.92e-7■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 UBE2N-205ENST00000550657 3018 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.782e-7■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.277e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.038e-13■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.018e-13■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.058e-13■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 PPP1R8-205ENST00000486634 459 ntTSL 37.09□□□□□ -1.278e-13■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RPS13-205ENST00000527571 777 ntTSL 220.77■□□□□ 0.922e-29■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RPS13-206ENST00000528074 583 ntTSL 219.21■□□□□ 0.672e-29■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RPS13-210ENST00000534329 568 ntTSL 216.52■□□□□ 0.242e-29■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SNRPA-202ENST00000596860 336 ntTSL 210.18□□□□□ -0.789e-11■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.451e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 FLOT1-205ENST00000438162 888 ntTSL 516.29■□□□□ 0.22e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.819e-9■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.769e-9■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.699e-9■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.459e-9■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.169e-9■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 HARS-208ENST00000504366 3494 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.649e-9■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TROVE2-203ENST00000367444 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.171e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TROVE2-202ENST00000367443 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.71e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TROVE2-204ENST00000367445 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.751e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.096e-7■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.316e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.256e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ILF2-204ENST00000480213 1008 ntTSL 58.73□□□□□ -1.016e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.039e-24■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.039e-24■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.659e-24■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.549e-24■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.439e-24■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.429e-24■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SLC3A2-220ENST00000542922 2174 ntTSL 215.18■□□□□ 0.029e-24■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SLC3A2-214ENST00000539507 534 ntTSL 38.32□□□□□ -1.089e-24■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.045e-12■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.495e-12■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.243e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.093e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.063e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 DBNL-208ENST00000441840 1854 ntTSL 521.51■■□□□ 1.033e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 DBNL-211ENST00000449997 2169 ntTSL 220.08■□□□□ 0.83e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 DBNL-221ENST00000497184 4090 ntTSL 1 (best)14.55□□□□□ -0.083e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 DBNL-204ENST00000432854 9618 ntTSL 512.84□□□□□ -0.353e-6■■□□□ 11.4
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