Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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