Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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