Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM2Q13029 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms