Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FOXC1Q12948 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FOXC1Q12948 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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FOXC1Q12948 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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FOXC1Q12948 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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FOXC1Q12948 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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FOXC1Q12948 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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FOXC1Q12948 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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FOXC1Q12948 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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FOXC1Q12948 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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FOXC1Q12948 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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