Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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