Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
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