Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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CNTN1Q12860 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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CNTN1Q12860 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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