Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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