Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FOXO1Q12778 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FOXO1Q12778 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FOXO1Q12778 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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FOXO1Q12778 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FOXO1Q12778 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FOXO1Q12778 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FOXO1Q12778 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FOXO1Q12778 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FOXO1Q12778 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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FOXO1Q12778 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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FOXO1Q12778 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FOXO1Q12778 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FOXO1Q12778 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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