Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP1B1Q10567 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms