Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms