Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms