Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms