Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAP1Q01518 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms