Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms