Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2BQ00403 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms